תכנית המלגות של קרן קלור נוסדה בשנת 1991 על ידי קרן קלור, במטרה לקדם מדענים ישראלים צעירים מצטיינים, בתקווה שהתכנית תתרום תרומה נכבדה לקידום המצוינות המדעית בישראל. הזוכים נבחרים מדי שנה מקרב הסטודנטים והחוקרים הצעירים בכל התחומים של מדעי הטבע, לרבות מתמטיקה, פיסיקה, כימיה, מדעי החיים, מדעי כדור הארץ, מדעי המחשב, חקלאות, הנדסה וטכנולוגיה. עשרה זוכים חדשים נבחרים מידי שנה, וכל אחד מהם זוכה למענק מחקר נדיב לשלוש שנים (העומד כיום על 100,000 ש"ח לשנה), מענק אישי והקצבה להוצאות הקשורות למחקר. התכנית מנוהלת על ידי מועצה בלתי תלויה, הכוללת מדענים בכירים מהאקדמיה, היושב ראש של קרן קלור לישראל, אחד הנאמנים, ואישי ציבור מובילים אחרים מתחומי הטכנולוגיה העילית ועולם העסקים